X-inaktivering under T-cellsutvecklingen i thymus
SND-ID: 2022-112-1. Version: 2. DOI: https://doi.org/10.5878/ayae-p143
Citering
Skapare/primärforskare
Olov Ekwall
- Göteborgs universitet, Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik
Forskningshuvudman
Göteborgs universitet
- Institutionen för kliniska vetenskaper
Beskrivning
Datasetet innehåller data från manuskriptet "A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus" av Gylemo et al och innehåller resultat från RNA-sekvensering (fastq.gz), analys av DNA-metylering (Grn.idat), Smart-seq2 single-cell RNA sekvensering (fastq.gz) och DNA-exomsekvensering (fastq.gz) av sex olika mognadsstadier av thymocyter från totalt nio individer.
Data är beskrivna på individ- och celltypsnivå i de bifogade tabbseparerade metadatafilerna (.tsv).
Kontrollsummor i MD5-format för datafilerna finns tillgängliga.
Data innefattar personuppgifter
Ja
Data innehåller känsliga personuppgifter
Ja
Typ av personuppgifter
Humandata. Data är pseudonymiserade och innhåller ID-nummer som kan kopplas till person via kodnyckel.
Kodnyckel existerar
Ja
Språk
Analysenhet
Population
Isolerade thymocyter från nio personer studerades. Försökspersonerna var fyra pojkar och fem flickor, alla under 3 år, som genomgick korrigerande hjärtkirurgi för medfödda hjärtmissbildningar.
Studiedesign
Experimentell studie
Urvalsmetod
Studie kopplad till biobank
Studien har samlat in nya prover/material som bevaras i en vetenskaplig samling eller biobank
Namn på vetenskaplig samling/biobank: Biobank Väst 890
Typ(er) av prov: Thymusvävnad
Studien har använt befintliga prover/material från en vetenskaplig samling eller biobank
Antal individer/objekt
9
Geografisk utbredning
Geografisk plats: Sverige
Ansvarig institution/enhet
Institutionen för kliniska vetenskaper
Övriga forskningshuvudmän
Medverkande
Colm E Nestor
- Linköpings universitet, Institutionen för biomedicinska och kliniska vetenskaper, Avdelningen för barns och kvinnors hälsa
Finansiering 1
-
Finansiär:
Vetenskapsrådet
- Diarienummer hos finansiär: 2018-02752
- Projektnamn på ansökan: Clinical and experimental studies of tolerance mechanisms in the thymus aiming at the development of therapeutic targeting of the thymus in the treatment of autoimmune diseases
Finansiering 2
-
Finansiär:
ALF Västra Götalandsregionen
- Diarienummer hos finansiär: ALFGBG-965795
- Projektnamn på ansökan: Kliniska och experimentella studier av toleransmekanismer i thymus
Etikprövning
Göteborg - dnr 217-12
Projektnamn: Studier av central toleransutveckling i human thymus
Forskningsområde
Immunologi inom det medicinska området (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)
Björn Gylemo, Maike Bensberg, Viktoria Hennings, Christina Lundqvist, , Alessandro Camponeschi, Dora Goldman, Aida Selimović, Antonio Lentini, Olov Ekwall, Colm E. Nestor (2024). A landscape of X-inactivation during human T-cell development [manuscript, resubmitted after revision].
Om du publicerat något baserat på det här datamaterialet, meddela gärna SND en referens till din(a) publikation(er). Är du ansvarig för katalogposten kan du själv uppdatera metadata/databeskrivningen via DORIS.
