Tillbaka till sökresultat

Cyp1A- och ABC-transportöruttryck och funktion i PLHC-1cellinje efter exponering för mikrocystin-LR och benso (a)pyren

SND-ID: 2024-450. Version: 1. DOI: https://doi.org/10.5878/bfa6-gd21

Ladda ner alla filer

2024-450-1.zip (~59.82 KB)

Citering

Skapare/primärforskare

Flavia Bieczynski - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap orcid

Malin Celander - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap orcid

Maja Edenius - Göteborgs universitet, IVL Svenska Miljöinstitutet

Annika Lindkvist - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap

Julio C. Painefilú - Comahue universitet, Biological and Geoenvironmental Technologies Patagonian Institute orcid

... Visa mer..

Flavia Bieczynski - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap orcid

Malin Celander - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap orcid

Maja Edenius - Göteborgs universitet, IVL Svenska Miljöinstitutet

Annika Lindkvist - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap

Julio C. Painefilú - Comahue universitet, Biological and Geoenvironmental Technologies Patagonian Institute orcid

Andrés Venturino - Comahue universitet, Environmental Toxicology and Agrobiotechnology Research Centre of Comahue orcid

Carlos M. Luquet - Comahue universitet, Laboratory of Aquatic Ecotoxicology orcid

Visa mindre..

Forskningshuvudman

Göteborgs universitet - Institutionen för biologi och miljövetenskap rorId

Beskrivning

Detta dataset inkluderar följande parametrar mätta i PLHC-1: cellinje.

1)Cyp1a-aktivitetsdata: Detta avsnitt innehåller rådata som används för att beräkna Cyp1a-aktivitet som EROD-aktivitet (etoxiresorufin-O-deetylas). Filerna inkluderar proteinkoncentration, EROD-lutning och specifik EROD-aktivitet, tillsammans med data från standardkurvor (BSA och resorufin). Dessutom finns det data från ett experiment som involverade pre-induktion av EROD-aktivitet med användning av β-naftoflavon. Detaljerade beskrivningar av mätförhållanden och beräkningar finns i den medföljande README-filen.

2) Cytotoxicitetsdata: Detta avsnitt tillhandahåller rådata (fluorescerande enheter) som används för att beräkna cytotoxicitet med två fluorescerande indikatorer: 5-Carboxyfluorescein Diacetate-Acetoximethyl Ester (CFDA-AM) och Alamar Blue (AB). README-filen innehåller beskrivningar av mätförhållandena och beräkningar.

3) qPCR-data: Detta inkluderar råa Ct-värden från qPCR-experiment.

4) Rhodamine 123-ackumuleringsdata: Detta av

Data innefattar personuppgifter

Nej

Språk

Metod och utfall

Tidsperiod(er) som undersökts

2022-05-01 – 2024-08-08

Dataformat / datastruktur

Arter och taxon

Poeciliopsis lucida (fish) hepatocellular carcinoma cell line (plhc-1)

Datainsamling
  • Insamlingsmetod: Laboratorieexperiment
  • Beskrivning av insamlingsmetod:
    The data were collected through laboratory experiments conducted at the Department of Biological and Environmental Sciences, University of Gothenburg. All experiments took place in 2022, except for the half-maximal inhibition concentration (IC50) assays for benzo[a]pyrene (BaP) on CYP1A-mediated EROD activity in PLHC-1 cells pre-exposed to BNF (performed in July 2024).

    The PLHC-1 cell line (ATCC® CRL-2406TM) was obtained from LGC Standards (Borås, Sweden). Cells were cultured in tightly capped 75 cm² cell culture flasks with 25 mM HEPES-buffered MEM, pH 7.1, supplemented with 5% (v/v) FBS at 30 ºC. For each assay, cells were seeded as follows:
    - EROD and Rh123 accumulation assay: 48-well plates, 6 × 10⁵ cells/mL in 500 µL per well.
    - Cytotoxicity Analyses: 96-well plates, 5 × 10⁵ cells/mL in 200 µL per well.
    - mRNA Expression Analyses: 6-well plates, 2 × 10⁶ cells/mL in 2 mL per well.

    After a 24-hour incubation post-seeding, media were removed from each well, and cells were rinsed with 10 mM Na-phosphate buffer, pH 7.4, containing 0.9% (w/v) NaCl (PBS). Cells were then exposed to DMSO (control), MCLR, BaP, or their mixture. EROD activity, Rh123 accumulation, cytotoxicity, and mRNA expression were measured on separate plates, with each type of measurement conducted on different days.

    Data were recorded using a VICTORTM 1420 Multilabel Counter (Wallac Sverige AB) for EROD, cytotoxicity, and Rh123 assays, and an iCYCLER instrument (Bio-Rad) for qPCR.
  • Tidsperiod(er) för datainsamling: 2022-05-01 – 2024-08-08
  • Datainsamlare: Göteborgs universitet rorId
  • Instrument: VICTORTM 1420 Multilabel Counter - fluorometer VICTORTM 1420 Multilabel Counter from Wallac Sverige AB
  • Instrument: iCYCLER instrument (Bio-Rad) - iCYCLER instrument (Bio-Rad)
  • Datakälla: Biologiska prover
Geografisk täckning
Administrativ information

Ansvarig institution/enhet

Institutionen för biologi och miljövetenskap

Finansiering 1

  • Finansiär: CONICET rorId
  • Diarienummer hos finansiär: RD - EX-2021-93553723-APN-CB#CONICET
  • Projektnamn på ansökan: Effects of the combination of cyanotoxins and polycyclic aromatic hydrocarbons on the multiple xenobiotic resistance system in fish
  • Information om finansiering: Partial Funding Program for Assistant Researchers, CONICET, 2021, to F. Bieczynski

Finansiering 2

  • Finansiär: National Agency for the Promotion of Research, Technological Development and Innovation rorId
  • Diarienummer hos finansiär: PICT 2019-649
  • Projektnamn på ansökan: Evaluation of combined effects of contaminants and environmental risk on fish present in the waters of Northern Patagonia
  • Information om finansiering: PICT 2019-649 to F. Bieczynski

Finansiering 3

  • Finansiär: National Agency for the Promotion of Research, Technological Development and Innovation. rorId
  • Diarienummer hos finansiär: PIP 2753
  • Information om finansiering: PIP 2753 to C. Luquet

Finansiering 4

  • Finansiär: Wenner-Gren Stiftelserna rorId
  • Diarienummer hos finansiär: GFOv2024-004
  • Projektnamn på ansökan: Chemical Interactions on the Detoxification Pathway in Fish Liver Cells Exposed to Mixtures
  • Information om finansiering: GFOv2024-004 to M. C. Celander

Finansiering 5

  • Finansiär: Carl Trygger Foundation rorId
  • Diarienummer hos finansiär: 942-215-605
  • Information om finansiering: 942-215-605 to M. Edenius
... Visa mer..

Finansiering 1

  • Finansiär: CONICET rorId
  • Diarienummer hos finansiär: RD - EX-2021-93553723-APN-CB#CONICET
  • Projektnamn på ansökan: Effects of the combination of cyanotoxins and polycyclic aromatic hydrocarbons on the multiple xenobiotic resistance system in fish
  • Information om finansiering: Partial Funding Program for Assistant Researchers, CONICET, 2021, to F. Bieczynski

Finansiering 2

  • Finansiär: National Agency for the Promotion of Research, Technological Development and Innovation rorId
  • Diarienummer hos finansiär: PICT 2019-649
  • Projektnamn på ansökan: Evaluation of combined effects of contaminants and environmental risk on fish present in the waters of Northern Patagonia
  • Information om finansiering: PICT 2019-649 to F. Bieczynski

Finansiering 3

  • Finansiär: National Agency for the Promotion of Research, Technological Development and Innovation. rorId
  • Diarienummer hos finansiär: PIP 2753
  • Information om finansiering: PIP 2753 to C. Luquet

Finansiering 4

  • Finansiär: Wenner-Gren Stiftelserna rorId
  • Diarienummer hos finansiär: GFOv2024-004
  • Projektnamn på ansökan: Chemical Interactions on the Detoxification Pathway in Fish Liver Cells Exposed to Mixtures
  • Information om finansiering: GFOv2024-004 to M. C. Celander

Finansiering 5

  • Finansiär: Carl Trygger Foundation rorId
  • Diarienummer hos finansiär: 942-215-605
  • Information om finansiering: 942-215-605 to M. Edenius

Finansiering 6

  • Finansiär: Stiftelsen Forska Utan Djurförsök rorId
  • Diarienummer hos finansiär: S2021-0046
Visa mindre..
Ämnesområde och nyckelord

Forskningsområde

Biokemi och molekylärbiologi (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Nyckelord

Cytokrom p450-enzymsystemet, Cytotoxicitet, Abc transportör, Mikrocystin-lr, Etoxiresorufin-o-deetylasaktivitet, Qpcr, Polyaromatiska kolväten, Poeciliopsis lucida hepatocellulära karcinomcellinje

Publikationer

Title: Effects of Combined Exposures of Microcystin-Lr and Benzo[A]Pyrene on Detoxification Mechanisms in the Fish Liver Cell Line (Plhc-1).

Authors: Celander, Malin Charlotta and Bieczynski, Flavia and Edenius, Maja and Lindkvist, Annika and Painefilú, Julio C. and Venturino, Andres and Luquet, Carlos M.

This is a preprint article, it offers immediate access but has not been peer reviewed.

Available at SSRN: https://ssrn.com/abstract=4997829 or http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.4997829

Journal: Aquatic Toxicology

SND Logo

Versioner

Version 1. 2025-01-31

Version 1: 2025-01-31

DOI: https://doi.org/10.5878/bfa6-gd21

Kontakt för frågor om data

Publicerad: 2025-01-31