I denna studie analyserades DNA extraherat från honungsbin med hjälp av qPCR för närvaron och kvantiteten av olika honungsbispecifika mjölksyrabakterier. Syftet var att undersöka om det finns skillnader i sammansättningen av mjölksyrabakterier hos bin från bisamhällen och bigårdar med eller utan sjukdomen amerikansk yngelröta. I datafilen "Sample_info" hittas bakgrundsinformation för de individuella proverna, filen innehåller 7 kolumner och 42 rader. I datafilen "Data_LAB_AFB_in_Sweden" hittas Cq-värden för alla prover och bakterier, filen innehåller 11 kolumner och 493 rader. I filen "Bactdilutions" hittas bakteriekoncentrationer och Cq-värden för seriespädningar av bakterierna som proverna analyserats för, filen innehåller 3 kolumner och 47 rader.

Data innefattar personuppgifter

Nej

Språk

Engelska

Metod och utfall

Tidsperiod(er) som undersökts

2018-05 – 2018-06

Dataformat / datastruktur

Numeriska

Arter och taxon

Apis mellifera linnaeus, 1758
Bifidobacterium asteroides scardovi & trovatelli, 1969
Bifidobacterium coryneforme (ex scardovi & trovatelli, 1969) biavati et al., 1982
Apilactobacillus apinorum
Lactobacillus kullabergensis
Bifidobacteria asteroides
Lactobacillus apis
Bombilactobacillus mellis
Lactobacillus melliventris
Bifidobacteria coryneforme
Lactobacillus helsingborgensis
Apilactobacillus kunkeei
Lactobacillus kimbladii

Datainsamling

Insamlingsmetod: Övrigt
Beskrivning av insamlingsmetod: Datan har genererats genom qPCR-analyser av DNA extraherat från honungsbin.
Datainsamlare: Sveriges lantbruksuniversitet
Instrument: CFX96 Touch Real-Time PCR Detection System - qPCR-apparat från BioRad

Geografisk täckning

Geografisk utbredning

Geografisk plats: Sverige

Administrativ information

Ansvarig institution/enhet

Institutionen för ekologi

Medverkande

Paul D'Alvise - Universitetssjukhuset Tübingen, Institute for Clinical Microbiology and Hygiene

Eva Forsgren - Sveriges lantbruksuniversitet, Institutionen för ekologi

Meghan Milbraith - Sveriges lantbruksuniversitet, Institutionen för ekologi

Ämnesområde och nyckelord

Forskningsområde

Mikrobiologi (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Nyckelord

Mikrobiota, Bakterier, Mjölksyrebakterier, Amerikansk yngelröta, Paenibacillus larvae

Publikationer

Nilsson, A., D’Alvise, P., Milbrath, M. O., & Forsgren, E. (2024). Lactic acid bacteria in Swedish honey bees during outbreaks of American foulbrood. Ecology and Evolution, 14, e10964. https://doi.org/10.1002/ece3.10964
DOI: https://doi.org/10.1002/ece3.10964

Om du publicerat något baserat på det här datamaterialet, meddela gärna SND en referens till din(a) publikation(er). Är du ansvarig för katalogposten kan du själv uppdatera metadata/databeskrivningen via DORIS.