Tillbaka till sökresultat

Small non-coding RNA profiling across cellular and biofluid compartments and their implications for multiple sclerosis immunopathology

SND-ID: snd1150-1. Version: 1.0. DOI: https://doi.org/10.5878/c1mq-9r62

Citering

Skapare/primärforskare

Galina Zheleznyakova - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Eliane Piket - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Maria Needhamsen - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Maja Jagodic - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Forskningshuvudman

Karolinska Institutet - Institutionen för klinisk neurovetenskap rorId

Beskrivning

Små icke-kodade RNA (sncRNA) spelar en viktig roll i regleringen av olika processer i kroppen, särskilt i immunsystemet och kan lätt detekteras i kroppsvätskor. Projektets specifika syfte är att genomföra screening av små-icke-kodande RNA från perifert blod och cerebrospinalvätska hos MS-patienter i syfte att avslöja deras biologiska roll i MS och testa deras potential som nya MS-biomarkörer. Vi analyserade förändringarna i nivån av sncRNA i blod och cerebrospinalvätska hos patienter med MS (29) och kontroller (16). Patienter med olika former av MS inkluderades i analysen för att klargöra mekanismerna genom vilka sncRNA kan bidra till utvecklingen av en viss form av sjukdomen. Uppgifterna innehåller råinformation om molekyler för varje transkript.

För mer information se den engelska katalogsidan https://snd.gu.se/en/catalogue/study/SND1150

Data innefattar personuppgifter

Nej

Språk

Metod och utfall

Analysenhet

Population

Patienter med Multipel skleros (29), Kontroller (16)

Studiedesign

Observationsstudie

Beskrivning av studiedesign

Small non-coding RNAs were isolated from PBMC, plasma, CSF cells and CSF. The libraries were prepared as previously described (PMID: 27798564) and sequenced on two lanes of HiSeq2500. The data analysis was performed as previously described (PMID: 27798564).

Urvalsmetod

Studie kopplad till biobank

Ja

Variabler

4

Antal individer/objekt

176

Dataformat / datastruktur

Datainsamling
  • Insamlingsmetod: Fokusgrupp
  • Datakälla: Biologiska prover
Geografisk täckning

Geografisk utbredning

Geografisk plats: Sverige, Stockholms län, Stockholm kommun

Administrativ information

Ansvarig institution/enhet

Institutionen för klinisk neurovetenskap

Medverkande

Mohsen Khademi - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Diana Ekman - National Bioinformatics Infrastructure Sweden

Tomas Olsson - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Faiez Al Nimer - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Patrick Scicluna - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

... Visa mer..

Mohsen Khademi - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Diana Ekman - National Bioinformatics Infrastructure Sweden

Tomas Olsson - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Faiez Al Nimer - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Patrick Scicluna - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Omid Faridani - Karolinska Institutet, Ludwig Institute for Cancer Research

Michael Hagemann-Jensen - Karolinska Institutet, Ludwig Institute for Cancer Research

Fredrik Piehl - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Visa mindre..

Finansiering 1

  • Finansiär: Swedish MS Foundation

Finansiering 2

  • Finansiär: Region Stockholm

Finansiering 3

  • Finansiär: Hjärnfonden

Finansiering 4

  • Finansiär: Neuroförbundet

Finansiering 5

  • Finansiär: AstraZeneca-Science for Life Laboratory collaboration
... Visa mer..

Finansiering 1

  • Finansiär: Swedish MS Foundation

Finansiering 2

  • Finansiär: Region Stockholm

Finansiering 3

  • Finansiär: Hjärnfonden

Finansiering 4

  • Finansiär: Neuroförbundet

Finansiering 5

  • Finansiär: AstraZeneca-Science for Life Laboratory collaboration

Finansiering 6

  • Finansiär: Vetenskapsrådet

Finansiering 7

  • Finansiär: Horizon 2020

Finansiering 8

  • Finansiär: Svenska Läkaresällskapet
Visa mindre..

Etikprövning

Stockholm - dnr 2009/2107-31/2

Ämnesområde och nyckelord

Forskningsområde

Medicin och hälsovetenskap (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Nyckelord

Multipel skleros, Remitterande multipel skleros, Small non-coding rna analysis, Sekundär progressiv multipel skleros

Publikationer

Profiling of small non-coding RNAs across cellular and biofluid compartments: implications for multiple sclerosis immunopathology. Galina Yurevna Zheleznyakova, Eliane Piket, Maria Needhamsen, Michael Hagemann-Jensen, Diana Ekman, Mohsen Khademi, Faiez Al Nimer, Patrick Scicluna, Omid R Faridani, Tomas Olsson, Fredrik Piehl, Maja Jagodic. Deposited on bioRxiv.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.15.097519v1
DOI: https://doi.org/10.1101/2020.05.15.097519

Om du publicerat något baserat på det här datamaterialet, meddela gärna SND en referens till din(a) publikation(er). Är du ansvarig för katalogposten kan du själv uppdatera metadata/databeskrivningen via DORIS.

SND Logo

Versioner

Version 1.0. 2021-04-08

Version 1.0: 2021-04-08

DOI: https://doi.org/10.5878/c1mq-9r62

Publicerad: 2021-04-08
Senast uppdaterad: 2021-04-09