Data för: Prevalence and antimicrobial resistant Campylobacter spp. in broiler chicken carcasses and hygiene practises in informal urban markets in a low-income setting

SND-ID: 2024-635. Version: 1. DOI: https://doi.org/10.5878/p0p0-ag22

Citering

Skapare/primärforskare

Sofia Boqvist - Sveriges lantbruksuniversitet, Institutionen för husdjurens biovetenskaper orcid

Joseph Erume - Makerere University, Department of Biomolecular Resources and Biolab Sciences orcid

Pius Okello - Makerere University, Department of Biomolecular Resources and Biolab Sciences

Forskningshuvudman

Sveriges lantbruksuniversitet - Institutionen för husdjurens biovetenskaper rorId

Diarienummer hos huvudman

SLU.hbio.2025.IÄ-1

Beskrivning

Projektet syftade till att bidra till minskad spridning av antimikrobiellt resistenta (AMR) zoonotiska bakterier i urbana djurhållningssystem i låginkomstländer (LIC). Detta har gjorts genom att tillhandahålla ny data om spridning och diversitet av AMR Campylobacter-stammar. Faktorer för att minska sjukdomar och användningen av antimikrobiella medel kommer har också identifierats, vilket kommer att underlätta framtida initiativ för samordnade åtgärder för att minska spridningen av AMR.

I projektet undersöktes prevalensen av Campylobacter på slaktkycklingkroppar som såldes på informella marknader runt huvudstaden Kampala i Uganda. Antimikrobiell resistens mot de isolerade campylobactstammarna analyserades mot fem olika antibiotika; tetracycline, ciprofloxacin, streptomycin, erythromycin och nalidixic acid. Datafilen innehåller 36 rader (Campylobacter stammar) och 14 kolumner och data förklaras i dokumentationsfilen "read_me_AMR_campylobacter".

De försäljare som saluförde slaktkycklingkropparna, som ingick i studien, intervjuades muntligen utifrån ett frågeformulär för att få information kring

... Visa mer..
Projektet syftade till att bidra till minskad spridning av antimikrobiellt resistenta (AMR) zoonotiska bakterier i urbana djurhållningssystem i låginkomstländer (LIC). Detta har gjorts genom att tillhandahålla ny data om spridning och diversitet av AMR Campylobacter-stammar. Faktorer för att minska sjukdomar och användningen av antimikrobiella medel kommer har också identifierats, vilket kommer att underlätta framtida initiativ för samordnade åtgärder för att minska spridningen av AMR.

I projektet undersöktes prevalensen av Campylobacter på slaktkycklingkroppar som såldes på informella marknader runt huvudstaden Kampala i Uganda. Antimikrobiell resistens mot de isolerade campylobactstammarna analyserades mot fem olika antibiotika; tetracycline, ciprofloxacin, streptomycin, erythromycin och nalidixic acid. Datafilen innehåller 36 rader (Campylobacter stammar) och 14 kolumner och data förklaras i dokumentationsfilen "read_me_AMR_campylobacter".

De försäljare som saluförde slaktkycklingkropparna, som ingick i studien, intervjuades muntligen utifrån ett frågeformulär för att få information kring kunskaper, tillämpning och rutiner kring livsmedelssäkerhet och livsmedelshygien på de inkluderade marknaderna. Datafilen innehåller 120 rader (respondenter) och 41 kolumner (enkätfrågor). Data förklaras i dokumentationsfilen "read_me_food_safety_questionnaire_results". Visa mindre..

Data innefattar personuppgifter

Nej

Språk

Metod och utfall

Analysenhet

Population

Populationen består av slaktkycklingar som säljs på informella marknader i Kampala, Uganda, samt försäljarna.

Tidsdimension

Studiedesign

Observationsstudie

Beskrivning av studiedesign

Denna studie, som genomfördes mellan februari och augusti 2022 i distrikten Kampala, Wakiso och Mukono i Uganda, innefattade insamling av slaktkycklingkroppar och intervjuer med marknadsförsäljare. Tio marknader per distrikt valdes slumpmässigt från officiella listor. Totalt samlades 124 kycklingkroppar in, tillräckligt för att upptäcka en prevalens på 75% med 5% felmarginal och 80% konfidensnivå.
Fyra kycklingkroppar per marknad analyserades enligt ISO-metoder för att påvisa förekomst av Campylobacter. De isolerade bakteriestammarna konfirmerades med PCR och underart (specie) bestämdes. Samtliga isolerade bakteriestammar testades även för antimikrobiell resistens med Disc Diffusion-test.
Information kring försäljarnas kunskaper om livsmedelsburna sjukdomar, hygienrutiner och attityder kring livsmedelshygien samlades in muntligen med hjälp av ett frågeformulär som bestod av 34 frågor.

Urvalsmetod

Blandat sannolikhets- och icke-sannolikhetsurval
Antalet prover bestämdes utifrån en förväntad prevalens på 75%, med en uppskattad felmarginal på 5% och en konfidensnivå på 80%. Urvalsstorleken sattes till 120. Fyra kycklingkroppar per marknad insamlades, en från varje försäljare. Totalt inkluderades 30 marknader. Information kring försäljarnas kunskaper om livsmedelsburna sjukdomar, hygienrutiner och attityder kring livsmedelshygien samlades in muntligen med hjälp av ett frågeformulär som bestod av 41 frågor.

Tidsperiod(er) som undersökts

2022-02 – 2022-09

Variabler

48

Antal individer/objekt

120

Svarsfrekvens/deltagarfrekvens

100%

Alla marknadsförsäljare vi valde ut deltog i studien.

Dataformat / datastruktur

Datainsamling
  • Insamlingsmetod: Personlig intervju
  • Beskrivning av insamlingsmetod: En skriftlig enkät användes för att samla information om de inkluderade försäljarnas kunskaper och rutiner relaterade till livsmedelsburna sjukdomar och antimikrobiell resistens (AMR), med fokus på spridning och begränsning av livsmedelsburna bakterier på informella marknader. Slaktade kycklingar köptes in från de intervjuade försäljarna.
  • Tidsperiod(er) för datainsamling: 2022-02 – 2022-09
  • Datainsamlare: Makerere University rorId
  • Prov: kycklingkroppar
  • Urvalsstorlek: 120
  • Antal svar: 120
  • Datakälla: Biologiska prover
Geografisk täckning

Geografisk utbredning

Geografisk plats: Uganda

Geografisk beskrivning: Urban and periurban Kampala

Högsta geografiska enhet

Län (NUTS 3)

Administrativ information

Ansvarig institution/enhet

Institutionen för husdjurens biovetenskaper

Övriga forskningshuvudmän

Finansiering

  • Finansiär: Vetenskapsrådet rorId
  • Diarienummer hos finansiär: 2020-03631_VR
  • Projektnamn på ansökan: Antibiotikaresistens hos zoonotiska agens - en utmaning för stadsnära småskalig djurproduktion
  • Information om finansiering:
    I låginkomstländer är fjäderfäproduktion viktig för försörjning samt för livsmedelstrygghet och nutrition. Campylobacterios är en av de största bakteriella folkhälsoriskerna globalt, och kycklingprodukter är den viktigaste smittvägen. Dessutom är AMR hos Campylobacter av ökande betydelse. Projektet har genomförts på livsmedelsmarknader i Kampala, Uganda. Data har samlats in om förekomst av campylobacter, antibiotikaresistens, och rutiner och kunskaper kring livsmedelssäkerhet och hygienrutiner på informella marknader. Detta är relevanta kunskaper för att på sikt begränsning betydelsen av AMR Campylobacter.
    Projektet fokuserar på utmaningar med urban djurhållning, AMR och antibiotikaanvändning samt patogena zoonotiska bakterier i ett sammanhang. Det fokuserar på kunskapsluckor relaterade till spridning av zoonotiska bakterier som är resistenta mot antibiotika vid specifika punkter i fjäderfäkedjan. De framtagna resultaten kommer sannolikt att vara relevanta även för andra länder i Östafrika, eftersom få studier har publicerats om AMR och Campylobacter i denna region.
Ämnesområde och nyckelord

Forskningsområde

Mikrobiologi (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Patobiologi (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Publikationer

Licens

CC0 1.0

Versioner

Version 1. 2025-01-20

Version 1: 2025-01-20

DOI: https://doi.org/10.5878/p0p0-ag22

Kontakter för frågor om data

Publicerad: 2025-01-20
Senast uppdaterad: 2025-01-20