SUPPLEMENTARY MATERIAL: VisuNet: an interactive tool for rule network visualization of rule-based learning models

SND-ID: 2024-342. Version: 1. DOI: https://doi.org/10.57804/x4y3-g283

Citering

Skapare/primärforskare

Karolina Smolinska Garbulowska - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik orcid

Mateusz Garbulowski - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik

Klev Diamanti - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik, Institutionen för immunologi, genetik och patologi orcid

Xavier Davoy - The Grenoble Institute of Technology– Phelma

Stephen Omondi Otieno Anyango - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik

... Visa mer..

Karolina Smolinska Garbulowska - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik orcid

Mateusz Garbulowski - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik

Klev Diamanti - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik, Institutionen för immunologi, genetik och patologi orcid

Xavier Davoy - The Grenoble Institute of Technology– Phelma

Stephen Omondi Otieno Anyango - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik

Fredrik Barrenäs - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik

Susanne Bornelöv - Uppsala universitet / University of Cambridge, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi, Institutionen för cell- och molekylärbiologi / Cancer Research UK Cambridge Institute orcid

Jan Komorowski - Uppsala universitet, Kollegiet för avancerade studier (SCAS), Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik orcid

Visa mindre..

Forskningshuvudman

Uppsala universitet rorId

Beskrivning

The data consists of a pdf file with visualizations and an excel file with following tables:

- Table S1 The overview of applications.

- Table S2 SFARI result for 4 genes overlapped the rule-network of case-control study of autism and the SFARI genes databese.

- Table S3 GO over-representation results for the rule-network of case-control study of autism.

- Table S4 Full list of variables used for the rule-based machine learning schema. The list includesmetabolites and pools of metabolites.

... Visa mer..
The data consists of a pdf file with visualizations and an excel file with following tables:

- Table S1 The overview of applications.

- Table S2 SFARI result for 4 genes overlapped the rule-network of case-control study of autism and the SFARI genes databese.

- Table S3 GO over-representation results for the rule-network of case-control study of autism.

- Table S4 Full list of variables used for the rule-based machine learning schema. The list includesmetabolites and pools of metabolites.

- Table S5 List of rules for the R.ROSETTA model including support, accuracy and BH-corrected p-value for each rule.

Datasetet har ursprungligen publicerats i DiVA och flyttades över till SND 2024. Visa mindre..

Data innefattar personuppgifter

Nej

Språk

Metod och utfall
Datainsamling
Geografisk täckning
Administrativ information

Identifierare

Ämnesområde och nyckelord

Forskningsområde

Bioinformatik och systembiologi (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Publikationer
Publicerad: 2021-10-11
Senast uppdaterad: 2024-06-24