SUPPLEMENTARY MATERIAL: Transcriptomic analysis reveals pro-inflammatory signatures associated with acute myeloid leukemia progression

Svea Stratmann - Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Experimentell och klinisk onkologi / Science for Life Laboratory

Sara A. Yones - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi / Science for Life Laboratory

Mateusz Garbulowski - Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräkningsbiologi och bioinformatik

Jitong Sun - Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Experimentell och klinisk onkologi / Science for Life Laboratory

Aron Skaftason - Karolinska Institutet, Institutionen för molekylär medicin och kirurgi

Markus Mayrhofer - Uppsala universitet, Science for Life Laboratory

Nina Norgren - Umeå universitet, Institutionen för molekylärbiologi, Nationell Bioinformatik Infrastruktur Sverige / Science for Life Laboratory

Morten Krogh Herlin - Århus universitet, Institutionen för klinisk medicin / Institutionen för pediatrik och ungdomsmedicin

Christer Sundström - Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Klinisk och experimentell patologi / Science for Life Laboratory

Anna Eriksson - Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper, Hematologi

Martin Höglund - Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper, Hematologi / Institutionen för medicinska vetenskaper

Josefine Palle - Uppsala universitet, Institutionen för kvinnors och barns hälsa, Neuropediatrik, Pediatrisk onkologi / Science for Life Laboratory

Jonas Abrahamsson - Sahlgrenska akademin vid Göteborgs universitet, Institutionen för pediatrik, Institutionen för kliniska vetenskaper

Kirsi Jahnukainen - Helsingfors universitet och Helsingfors universitetscentralsjukhus, Barnsjukhuset

Monica Cheng Munthe-Kaas - Norska Folkhälsoinstitutet

Bernward Zeller - Oslo universitetssjukhus, Avdelningen för barn- och ungdomsmedicin

Katja Pokrovskaja Tamm - Karolinska Institutet och Karolinska Universitetssjukhuset, Institutionen för onkologi och patologi

Lucia Cavelier - Uppsala universitet, Department of Immunology, Genetics and Pathology / Science for Life Laboratory

Visa mindre..

Studie beskriven i den engelska versionen av denna katalogpost.

Data består av en kompletterande Pdf-fil och en Excel-fil med följande tabeller:

Kompletterande tabell 1. Översikt över urval av studiekohort
Kompletterande tabell 2. Egenskaper för urvalet av studiekohorten
Kompletterande tabell 3. Klinisk information
Kompletterande tabell 4. Egenskaper hos CD34+ BM-kontrollprover
Kompletterande tabell 5. Information om antikroppar
Kompletterande tabell 6. Statistik för RNA-seq
Kompletterande tabell 7. SNV:er och små InDels som upptäckts med RNA-seq
Kompletterande tabell 8. Samlade metadata och RNA-seq- och WGS/WES-resultat
Kompletterande tabell 9. Fusionstranskript i R/PR AML
Kompletterande tabell 10. Provanvändning för generering av olika analyser
Kompletterande tabell 11. DEG associerade med kort kontra lång EFS
Kompletterande tabell 12. GO-analys av DEG mellan korta och långa EFS-associerade prover
Kompletterande tabell 13. Statistik i samband med överlevnadsanalyser
Kompletterande tabell 14. DEG mellan patientmatchade diagnos- och återfallsprover
Kompletterande tabell 15. GO-analys av DEGs mellan patientmatchade diagnos- och återfallsprover
Kompletterande tabell 16. Regler för maskininlärningsmodeller för diagnos och återfall i AML hos vuxna
Kompletterande tabell 17. Regler för maskininlärningsmodeller för diagnos och återfall i AML hos barn
Kompletterande tabell 18. Modellregler för maskininlärning för diagnos och återfall i pediatrisk AML (funktioner sammanslagna med TARGET)
Kompletterande tabell 19. Modellregler för maskininlärning för diagnos och återfall i TARGET-kohorten (funktioner sammanslagna med Local Pediatric)
Kompletterande tabell 20. Verifiering av transkriptomiska fusionshändelser och tillhörande primerinformation

Datasetet har ursprungligen publicerats i DiVA och flyttades över till SND 2024. Visa mindre..