Tillbaka till sökresultat

Evaluating Feature Extraction in Ovarian Cancer Cell Line Co-Cultures Using Deep Neural Networks

SND-ID: 2024-175. Version: 1. DOI: https://doi.org/10.48723/srtg-ss33

Tillhörande dokumentation

Citering

Skapare/primärforskare

Osheen Sharma - Karolinska Institutet, Institutionen för onkologi-patologi orcid

Brinton Seashore-Ludlow - Karolinska Institutet, Institutionen för onkologi-patologi orcid

Forskningshuvudman

Karolinska Institutet - Institutionen för onkologi-patologi rorId

Beskrivning

Detta dataset innehåller detaljerade bilddata från olika kokulturanalyser av äggstockscancer- och fibroblastcellinjer, behandlade med ett brett utbud av läkemedel. Se utförligare beskrivning i den engelska versionen av katalogposten.

Datasetet är tillgängligt för nedladdning i fem separata ZIP-arkiv: Kuramochi_BjhTERT.zip, (93,68 GB), Kuramochi_WI38.zip (93,50 GB), MH_BjhTERT.zip (62,22 GB), OvCar3_BjhTERT.zip (84,98 GB), OvCar8_WI38.zip (91,89 GB).

Filstrukturen finns beskriven i den tillhörande dokumentationsfilen Dataset_Description.pdf.

Data innefattar personuppgifter

Nej

Språk

Metod och utfall

Analysenhet

Population

Datasetet består av bilder av äggstockscancercellinjer och fibroblastcellinjer som odlats tillsammans (2D-kokultur) i en 384-brunnars mikrotiterplatta (in vitro). I vår analys är varje enskild cell ett objekt. Dessa samodlingar används för att studera hur cancer- och fibroblastceller interagerar med varandra och vid läkemedelspåverkan samt hur cancercellernas morfologi förändras

Tidsdimension

Studiedesign

Experimentell studie

Urvalsmetod

Dataformat / datastruktur

Datainsamling
Geografisk täckning
Administrativ information

Ansvarig institution/enhet

Institutionen för onkologi-patologi

Medverkande

Greta Gudoitytė - Karolinska Institutet, Institutionen för onkologi-patologi

Finansiering 1

  • Finansiär: Vetenskapsrådet rorId
  • Diarienummer hos finansiär: 2021-03420

Finansiering 2

  • Finansiär: Åke Wibergs Stiftelse rorId
  • Diarienummer hos finansiär: M19-0271

Finansiering 3

  • Finansiär: Karolinska Institutet rorId
  • Diarienummer hos finansiär: KID, 2020-01096
  • Information om finansiering: Karolinska Institute Doktorandmedel, KID-medel
Ämnesområde och nyckelord

Forskningsområde

Bioinformatik (beräkningsbiologi) (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Datorseende och robotik (autonoma system) (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Cellbiologi (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Bioinformatik och systembiologi (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Cancer och onkologi (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Nyckelord

Neural network, Äggstockscancer cellinjer, Fibroblastcellinjer, Image analysis, Morfologiska egenskaper, Mechanism of action, High content imaging

Publikationer
SND Logo

Versioner

Version 1. 2025-01-16

Version 1: 2025-01-16

DOI: https://doi.org/10.48723/srtg-ss33

Kontakt för frågor om data

Brinton Seashore-Ludlow

brinton.seashore-ludlow@ki.se

Publicerad: 2025-01-16