Begränsad tillväxt av fjällbjörkplantor över årtionden har liten inverkan på den omgivande tundran

Ruud Scharn - Göteborgs universitet, Institutionen för geovetenskaper

Isabel S. Negri - Cardiff University, School of Biosciences

Jørn O. Løkken - Norwegian Institute for Nature Research

Christine D. Bacon - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap

Alexandre Antonelli - Royal Botanical Gardens Kew

Annika Hofgaard - Norwegian Institute for Nature Research

R. Henrik Nilsson - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap

Robert Björk - Göteborgs universitet, Institutionen för geovetenskaper

Visa mindre..

Studien tar upp två viktiga frågor om fjällbjörkens, som är den dominerande arten i trädgränsen, förflyttning upp på kalfjället:

• Hur klarar sig björkplantorna som har etablerats ovanför trädgränsen?
• Hur påverkar dessa björkplantor den omgivande vegetationen på kalfjället?

Vi samlade in data om artförekomsten av växter i 50 x 50 cm stora provytor runt björkplantor ovanför trädgränsen nära Latnjajaure Fältstation i norra Sverige. Dessa mätningar jämfördes med kontrollmätningar och referensmätningar gjorda under trädgränsen. Vi tittade också på björkplantornas tillväxt (diameter + längd) under de senaste 15 åren, från 2001 till 2016. De data som deponerats i datasetet omfattar rådata, kod och statistiska modeller som används för att analysera data samt alla utdata (figurer och tabeller) som används i studien. Ytterligare metadata finns i README-filen som ingår.

ALLMÄN INFORMATION

1. Datasetets titel:
Begränsad tillväxt av fjällbjörkplantor över årtionden har liten inverkan på den omgivande tundran

2. Information om författarna
A. Kontaktuppgifter till huvudförfattaren
Namn: Ruud Scharn
Lärosäte: Göteborgs universitet
E-post: ruud.scharn@gu.se

B. Kontaktuppgifter för medförfattaren
Namn: Robert Björk
Lärosäte: Göteborgs universitet
E-post: robert.bjork@gu.se


3. Datum för datainsamling: 2016-07-(4-31)

4. Geografisk plats för datainsamling
Latnjajaure fältstation nära Abisko i norra Sverige (68,35°N, 18,49°E).


ÖVERSIKT ÖVER DATA OCH FILER

Filen birch_coordinates.csv innehåller koordinaterna för varje björk (WGS84 och SWEREF99) tillsammans med höjd, antal stammar, stamdiameter och antal grenar.

För varje analys i artikeln har vi skapat en mapp som innehåller tre undermappar.

Huvudmapparna:
1 alpha diversity altitude slope
2 alpha diversity intercept only
3 Beta diversity
4 Diameter and length

Undermapparna är strukturerade på samma sätt för alla huvudmappar som innehåller:

1 input: innehåller råa indata.
2 script: R-skript som innehåller all databehandling samt JAGS-skriptet som innehåller den kod som används i den statistiska modelleringen. R-skripten bör kunna köras under förutsättning att sökvägen till indata är korrekt inställd (se setwd i början av skriptet) och att de nödvändiga biblioteken är lokalt installerade.
3 output: innehåller tabeller och figurer.

Rådata för huvudmapparna 1-3 är samma och innehåller:
Latnja2006-16.txt: en tabbseparerad matris som innehåller uppskattningar av täckningsgraden för arterna (kolumner) för provytorna (rader). rownames innehåller vilken växtsamhälle det är (Bpt_Ref, Bpt och C för referens-, björk- och kontrollytor) och provytornas höjd i meter över havet.
norway_latnjatree.dated.tre: daterad fylogeni i Newick format av scharn et al 2021 (doi: https://doi.org/10.1088/1748-9326/abfe8a) som används för uppskattning av fylogenetisk mångfald.

Undermapp input i huvudmapp 3 (Beta_diversity) innehåller netMPD_sweden.rds, en serialiserad R-objektfil som innehåller medelparvisa avstånd för arten.

Huvudmapp 4 innehåller:
Birch_heigh_Diameter.csv: en kommaseparerad matris som innehåller björknummer, provtagningsår, björkplantornas höjd och diameter.
Birch_heigh_Diameter_dif.csv: en kommaseparerad matris som innehåller björknumret samt skillnaden i höjd och diameter mellan åren.

METODOLOGISK INFORMATION

1. Beskrivning av de metoder som använts för insamling/generering av data:
Metoderna finns i "Limited decadal growth of mountain birch saplings has a minor impact on surrounding tundra vegetation" (se tillhörande publikation). Visa mindre..