INDILACT - Förlängd frivillig väntetid för förstakalvare. Part 2: Individanpassad FVT - Metadata och R-script med statistiska beräkningar
SND-ID: 2024-424.
Åtkomst till data via
Tillhörande dokumentation
Citering
Alternativ titel
INDILACT - Part 2
Skapare/primärforskare
Anna Edvardsson Rasmussen - Sveriges lantbruksuniversitet
Forskningshuvudman
Sveriges lantbruksuniversitet - Institutionen för tillämpad husdjursvetenskap och välfärd
Diarienummer hos huvudman
SLU.klinvet.2024.4.4.IÄ-2
Beskrivning
Detta är del 2 i INDILACT, del 1 finns publicerad separat.
Studien syftar till att undersöka hur individanpassad frivillig väntetid melan kalvning och första insemination påverkar mjölkproduktion, fertilitet och hälsa för förstakalvare under deras första kalvningsintervall.
Data registrerades mellan januari 2019 och oktober 2022.
Denna data finns arkiverad:
- Metadata (Excel och PDF): tillgänglig
- Rådata (.txt filer) från kokontrollen som drivs av Växa Sverige: begränsad åtkomst pga avtal med VÄXA och gårdarna som äger datan, kodlistor finns tillgängligt i INDILACT del 1.
- Aggregated data (Excel filer): begränsad åtkomst pga avtal med VÄXA och gårdarna som äger datan
Studien syftar till att undersöka hur individanpassad frivillig väntetid melan kalvning och första insemination påverkar mjölkproduktion, fertilitet och hälsa för förstakalvare under deras första kalvningsintervall.
Data registrerades mellan januari 2019 och oktober 2022.
Denna data finns arkiverad:
- Metadata (Excel och PDF): tillgänglig
- Rådata (.txt filer) från kokontrollen som drivs av Växa Sverige: begränsad åtkomst pga avtal med VÄXA och gårdarna som äger datan, kodlistor finns tillgängligt i INDILACT del 1.
- Aggregated data (Excel filer): begränsad åtkomst pga avtal med VÄXA och gårdarna som äger datan
- R- script med statistiska beräkningar
Metadata (3 filer):
- Metadata gentypning: Den enda nya filtypen jämfört med INDILACT del 1, beskrivning hur denna kategori av data har hanterats - i övriga filtyper har hanterats på samma sätt som i INDILACT del 1.
- Metadata - del 2 - generell sammanfattning över grundläggande datahantering för aggregering av datafiler (datum osv) för att skapa de excelfiler som sedan använts som grundfiler för R-scripten.
- DisCodes: Indelning av diagnoser i sjukdomskategorier.
Rådata:
-59 .txt filer med kokontrolldata uttagna vid 8 tillfällen.
-Data från 18 svenska gårdar från jan 2019 till okt 2022.
Aggregerade data:
- 29 Excelfiler. Textfilerna har bearbetats till användbart format så all data av samma typ från alla 8 tillfällen finns i samma Excelfil.
- Insamlade data från gårdarna via mail och telefonkontakt om de korna som inkluderats i försöket från oktober 2020 till oktober 2022.
- ett sammaslaget script med bearbetade data efter datahantering i R (output från scriptet "Data analysis part 2 - final") där relevanta variabler har räknats ut och sammanställts för vidare statistiska beräkningar.
R-script med datahantering och statistiska beräkningar:
- "Data analysis part 2 - final": Data hantering för att skapa filen med relevanta variabler som används i de statistiska beräkningarna.
- "Part 2 - Binomial models - Fertility": Statistiska beräkningar av variabler som kräver Binomiala modeller.
- "Part 2 - glmmTMB models - Fertility" : Statistiska beräkningar av variabler som kräver glmmTMB modeller.
- "Part 2 - linear models - Fertility": Statistiska beräkningar av fruktsamhetsvariabler som kräver linjära modeller.
- "Part 2 - linear models": Statistiska beräkningar av variabler som kräver linjära modeller - ffa mjölkvariabler. Visa mindre..
Data innefattar personuppgifter
Ja
Typ av personuppgifter
SE nummer till gårdar som kodats
Kodnyckel existerar
Ja
Data innehåller annan skyddsvärd information
Ja: Avtal mellan SLU och gårdarna samt SLU och Växa Sverige finns om att data inte ska publiceras öppet så att man kan koppla resultat till enskilda gårdar.
Analysenhet
Population
Mjölkkor i 20 svenska kommersiella mjölkbesättningar i södra Sverige. Besättningar med minst 100 kor, god fruktsamhet och >9000 kg i medelårsmjölkavkastning.
Studiedesign
Experimentell studie
Beskrivning av studiedesign
Individanpassning av frivillig väntetid inna första insemination (och därmed kalvningsintervall) för förstakalvare som förväntas klara av ett förlängt KI baserrat på genetisk förutsättning för en ihållig laktationskurva, sjukdom eller kalvningsproblem i tidig laktation alternativt hög mjölkmängd i tidig laktation.
Urvalsmetod
Tidsperiod(er) som undersökts
2019-01-01 – 2022-10-27
Variabler
128
Antal individer/objekt
605
Dataformat / datastruktur
Arter och taxon
Bos taurus taurus linnaeus, 1758
Holstein dairy cows
Red dairy cattle
Ansvarig institution/enhet
Institutionen för tillämpad husdjursvetenskap och välfärd
Medverkande
Cecilia Kronqvist - Sveriges Lantbruksuniversitet, Institutionen för tillämpad husdjursvetenskap och välfärd
Erling Strandberg - Sveriges Lantbruksuniversitet, Institutionen för husdjurens biovetenskaper
Renée Båge - Sveriges Lantbruksuniversitet (SLU), Intitutionen för kliniska vetenskaper
Kjell Holtenius - Sveriges Lantbruksuniversitet (SLU), Institutionen för tillämpad husdjursvetenskap och välfärd
... Visa mer..Cecilia Kronqvist - Sveriges Lantbruksuniversitet, Institutionen för tillämpad husdjursvetenskap och välfärd
Erling Strandberg - Sveriges Lantbruksuniversitet, Institutionen för husdjurens biovetenskaper
Renée Båge - Sveriges Lantbruksuniversitet (SLU), Intitutionen för kliniska vetenskaper
Kjell Holtenius - Sveriges Lantbruksuniversitet (SLU), Institutionen för tillämpad husdjursvetenskap och välfärd
Växa Sverige
Visa mindre..Etikprövning
dnr Dnr 5.8.18-10126/2018 (Uppsala)
Det finns en godkänd etisk ansökan, för blod- och hårtpvbtagning för genetisk analys.
Forskningsområde
Husdjursvetenskap (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)
Sortera på namn | Sortera efter år
Edvardsson Rasmussen, A., Holtenius, K., Båge, R., Strandberg, E., Åkerlind, M., Kronqvist, C., 2024. Customized voluntary waiting period before first insemination in primiparous dairy cows. Effect on milk production, fertility and health. Journal of Dairy Science. https://doi.org/10.3168/jds.2023-24593
DOI:
https://doi.org/10.3168/jds.2023-24593
Edvardsson Rasmussen, A., 2023. Extended voluntary waiting period before first insemination in primiparous dairy cows : effects on milk production, fertility, and health. Acta Universitatis Agriculturae Sueciae. https://doi.org/10.54612/a.2skeendcfv
DOI:
https://doi.org/10.54612/a.2skeendcfv
ISSN:
1652-6880
Edvardsson Rasmussen, A., Båge, R., Holtenius, K., Strandberg, E., von Brömssen, C., Åkerlind, M., Kronqvist, C., 2023. A randomized study on the effect of an extended voluntary waiting period in primiparous dairy cows on fertility, health, and culling during first and second lactation. Journal of Dairy Science 106, 8897–8909. https://doi.org/10.3168/jds.2023-23470
DOI:
https://doi.org/10.3168/jds.2023-23470
Edvardsson Rasmussen, A., Holtenius, K., Båge, R., Strandberg, E., Åkerlind, M., Kronqvist, C., 2023. A randomized study on the effect of extended voluntary waiting period in primiparous dairy cows on milk yield during first and second lactation. Journal of Dairy Science 106, 2510–2518. https://doi.org/10.3168/jds.2022-22773
DOI:
https://doi.org/10.3168/jds.2022-22773
Om du publicerat något baserat på det här datamaterialet, meddela gärna SND en referens till din(a) publikation(er). Är du ansvarig för katalogposten kan du själv uppdatera metadata/databeskrivningen via DORIS.