Antikroppsnivåer mot Epstein Barr-virusantigen och molekylära sekvenshomologa proteinter hos patienter med multipel skleros och kontroller

SND-ID: 2025-21. Version: 1. DOI: https://doi.org/10.48723/0xhc-vp63

Lägg till förfrågan om data

Tillhörande dokumentation

MetaData.csv (3.88 KB)

MetaDescription.docx (16.48 KB)

Citering

Skapare/primärforskare

Ingrid Skelton Kockum - Karolinska Institutet, Institutionen för klinisk neurovetenskap

Forskningshuvudman

Karolinska Institutet - Institutionen för klinisk neurovetenskap / Institutet för miljömedicin

Beskrivning

Dessa data genererades med hjälp av plasmaprover från EIMS-studien (1). Det övergripande målet med EIMS studien är att förstå vilka livstil och genetiska faktorer som påverkar MS risk. Denna delstudies mål var att bättre förstå hur epstein barr virus kan påverka uppkomst av autoimmuna reaktioner. Studien inkluderar data från 661 populationsbaserade kontroller och 650 multipel sklerospatienter från Sverige. Datan består av antikroppsnivåer mätta med fluorescensaktiverad pärlbaserad analys. Prover kördes i duplikat. Nivåerna justerades mellan plattorna med användning av batchkontrollprover. De angivna värdena är medelvärdet av de två körningarna efter batchkorrigering.
HLA-genotyper har imputerats från SNP-genotyper i HlA-regionen av kromosom 6 med hjälp av HLA*IMP:02 som beskrivits tidigare (2).

Datasetet består av följande filer:
- PNAS_Data_combined.csv (433 kB)
- MetaData.csv
- MetaDescription.docx
Mer information om variablerna i tabellerna finns i dokumentationsfilen.

Data innefattar personuppgifter

Data innehåller känsliga personuppgifter

Typ av personuppgifter

Genetiska data (två alleler), födelseår, kön, ålder vid provtagning. Antikropps nivåer, kan tillsammans med data som finns lokalt leda till identifering av personerna

Språk

Engelska

Metod och utfall

Analysenhet

Individ/patient/person

Population

Patienter med multipel skleros i Sverige som gett sitt godkännande till att delta i EIMS studien samt populations baserade kontroller. Vi har analyserat plasma från blodprover från dessa individer för nivåer av antikroppar riktade mot Epstein Barr Virus antigen samt humana proteiner med aminosyra homologier med EBNA1 proteinet

Tidsdimension

Tvärsnitt

Studiedesign

Observationsstudie

Fall-kontrollstudie

Beskrivning av studiedesign

Ny diagnosticerade MS patienter har bjudits in att delta i studien som bestått av att svara på en enkät samt att lämna blodprov. Ålders, köns och region matchade kontroller har bjudits in att delta i studien, även de har svarat på en enkät och lämnat blodprov.

Urvalsmetod

Ny diagnosticerade MS patienter identiferade via neurologkliniker i sverige har bjudits in att delta i studien som bestått av att svara på en enkät samt att lämna blodprov. Ålders, köns och region matchade kontroller har bjudits in att delta i studien, även de har svarat på en enkät och lämnat blodprov.

Tidsperiod(er) som undersökts

2005 – 2024

Studie kopplad till biobank

Studien har använt befintliga prover/material från en vetenskaplig samling eller biobank

Namn på vetenskaplig samling/biobank: KI biobank

Typ(er) av prov: Plasma

Variabler

Antal individer/objekt

1311

Dataformat / datastruktur

Numeriska

Datainsamling

Geografisk täckning

Geografisk utbredning

Geografisk plats: Sverige

Geografisk beskrivning: Hela Sverige

Administrativ information

Ansvarig institution/enhet

Institutionen för klinisk neurovetenskap / Institutet för miljömedicin

Etikprövning

Etikprövningsmyndigheten - dnr 2019-00639

Ämnesområde och nyckelord

Forskningsområde

Neurovetenskaper (Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)

Specifika sjukdomar, störningar och medicinska tillstånd (CESSDA Topic Classification)

Nyckelord

Remitterande multipel skleros, Multipel skleros, Antikropp, Glialcam, Epstein barr virus, Ano2, Cryab

Publikationer

Neda Sattarnezhad1,2*, Ingrid Kockum3,4*, Olivia G. Thomas3,5, Yicong Liu3,4, Peggy P. Ho6, Alison K. Barrett7, Alexandros Comanescu7, Tilini U. Wijerante1, Paul J. Utz1, Lars Alfredsson3,8, Lawrence Steinman6, William H. Robinson1,9, Tomas Olsson3,4*, Tobias V. Lanz1,7*
Accepted for publication PNAS